Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GSK3BP49841 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms