Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK8P49336 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK8P49336 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK8P49336 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK8P49336 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK8P49336 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK8P49336 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK8P49336 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms