Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DCCP43146 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCCP43146 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCCP43146 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCCP43146 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCCP43146 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DCCP43146 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DCCP43146 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCCP43146 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCCP43146 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCCP43146 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DCCP43146 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DCCP43146 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
DCCP43146 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DCCP43146 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DCCP43146 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DCCP43146 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DCCP43146 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
DCCP43146 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DCCP43146 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCCP43146 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCCP43146 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCCP43146 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCCP43146 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCCP43146 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCCP43146 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCCP43146 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCCP43146 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCCP43146 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCCP43146 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCCP43146 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCCP43146 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DCCP43146 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCCP43146 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms