Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL35P42766 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms