Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FDFT1P37268 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms