Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms