Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDIT3P35638 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms