Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJA4P35212 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJA4P35212 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJA4P35212 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJA4P35212 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GJA4P35212 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA4P35212 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA4P35212 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA4P35212 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA4P35212 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA4P35212 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJA4P35212 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms