Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPC1P35052 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPC1P35052 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPC1P35052 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPC1P35052 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms