Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms