Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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