Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
S100A1P23297 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
S100A1P23297 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
S100A1P23297 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
S100A1P23297 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms