Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCEA1P23193 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms