Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2P22307 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2P22307 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2P22307 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SCP2P22307 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCP2P22307 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCP2P22307 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCP2P22307 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCP2P22307 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCP2P22307 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCP2P22307 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCP2P22307 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCP2P22307 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2P22307 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2P22307 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2P22307 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2P22307 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2P22307 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2P22307 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2P22307 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2P22307 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2P22307 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms