Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2CP19387 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms