Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCFC2P16383 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms