Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDPSP14324 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDPSP14324 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDPSP14324 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDPSP14324 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDPSP14324 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDPSP14324 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDPSP14324 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDPSP14324 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDPSP14324 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDPSP14324 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDPSP14324 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDPSP14324 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDPSP14324 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDPSP14324 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDPSP14324 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDPSP14324 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDPSP14324 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDPSP14324 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FDPSP14324 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDPSP14324 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDPSP14324 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDPSP14324 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FDPSP14324 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDPSP14324 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDPSP14324 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDPSP14324 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDPSP14324 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDPSP14324 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDPSP14324 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDPSP14324 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDPSP14324 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDPSP14324 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDPSP14324 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDPSP14324 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FDPSP14324 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms