Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCSHP14314 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCSHP14314 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCSHP14314 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCSHP14314 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCSHP14314 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCSHP14314 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCSHP14314 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCSHP14314 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRKCSHP14314 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRKCSHP14314 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCSHP14314 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms