Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD8P13378 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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