Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL11A1P12107 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms