Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB1P11230 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB1P11230 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms