Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMC1P11047 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms