Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PF4V1P10720 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms