Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms