Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP10P09238 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP10P09238 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP10P09238 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP10P09238 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP10P09238 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP10P09238 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP10P09238 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP10P09238 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP10P09238 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP10P09238 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP10P09238 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP10P09238 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP10P09238 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP10P09238 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms