Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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PKHD1P08F94 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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