Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPBP07199 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPBP07199 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPBP07199 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPBP07199 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPBP07199 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPBP07199 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPBP07199 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CENPBP07199 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CENPBP07199 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPBP07199 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPBP07199 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms