Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCAP05165 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCAP05165 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCAP05165 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCAP05165 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCAP05165 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCAP05165 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCAP05165 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCAP05165 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCAP05165 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCAP05165 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms