Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC3P02656 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC3P02656 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
APOC3P02656 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms