Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC1P02654 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC1P02654 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC1P02654 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC1P02654 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC1P02654 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC1P02654 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC1P02654 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms