Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms