Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms