Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG7O95352 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG7O95352 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG7O95352 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG7O95352 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG7O95352 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG7O95352 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG7O95352 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG7O95352 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG7O95352 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG7O95352 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG7O95352 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms