Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms