Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP9AO75110 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms