Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL41O60662 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL41O60662 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms