Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMFO60524 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMFO60524 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms