Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3APO60318 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms