Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXTL3O43909 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms