Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRODHO43272 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRODHO43272 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRODHO43272 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRODHO43272 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRODHO43272 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRODHO43272 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRODHO43272 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRODHO43272 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRODHO43272 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRODHO43272 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRODHO43272 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRODHO43272 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRODHO43272 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRODHO43272 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms