Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM2O43147 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms