Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms