Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APAF1O14727 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APAF1O14727 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APAF1O14727 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APAF1O14727 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APAF1O14727 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
APAF1O14727 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APAF1O14727 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APAF1O14727 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APAF1O14727 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APAF1O14727 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APAF1O14727 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APAF1O14727 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APAF1O14727 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms