Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ELL2O00472 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ELL2O00472 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ELL2O00472 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ELL2O00472 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ELL2O00472 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ELL2O00472 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ELL2O00472 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ELL2O00472 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ELL2O00472 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ELL2O00472 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ELL2O00472 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ELL2O00472 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ELL2O00472 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ELL2O00472 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ELL2O00472 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms