Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KR12 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KR12 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
J3KR12 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
J3KR12 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
J3KR12 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
J3KR12 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
J3KR12 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KR12 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms