Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms