Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms