Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRN3E7EW58 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRN3E7EW58 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms