Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms