Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8JA6NMD2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA8JA6NMD2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms